جنوبی افریقہ کا نیا کورونا وائرس ویرینٹ سٹرین 501Y-V2
18 دسمبر 2020 کو، جنوبی افریقہ میں نئے کورونا وائرس کے 501Y-V2 اتپریورتی کا پتہ چلا۔اب جنوبی افریقی اتپریورتی 20 سے زیادہ ممالک میں پھیل چکا ہے۔تجربات سے یہ بات سامنے آئی ہے کہ اوپر والے نئے کورونا وائرس اتپریورتیوں میں K417N/T، E484K اور N501Y اتپریورتن کے دیگر نئے کورونا وائرس کی مختلف حالتیں ہو سکتی ہیں جو کہ ویکسین کے ذریعے پلازما کو نیوٹرلائز کرنے والے اینٹی باڈیز کو بے اثر کرنے کی صلاحیت کو کم کر سکتی ہیں۔تاہم، حوالہ جینوم Wuh01 (سلسلہ نمبر MN908947) کے مقابلے میں، جنوبی افریقی اتپریورتی جینوم کی ترتیب کے 501Y.V2 میں 23 نیوکلیوٹائڈ مختلف قسمیں ہیں۔اس میں برطانیہ کے اتپریورتی B.1.1.7 ذیلی قسم کی طرح N501Y اتپریورتن ہے، لیکن پھر بھی S پروٹین کی دو اہم سائٹوں E484K اور K417N پر تغیرات موجود ہیں جو وائرس کے متاثر ہونے کی صلاحیت پر ممکنہ طور پر اہم اثرات مرتب کرتے ہیں۔
نیا کورونا وائرس ایک سنگل پھنسے ہوئے آر این اے وائرس ہے، جس میں جینوم کی تبدیلیاں زیادہ ہوتی ہیں۔سنگل ٹارگٹ کا پتہ لگانے سے کم وائرل لوڈ اور تبدیل شدہ وائرس کے تناؤ والے نمونوں کی آسانی سے کھوئی ہوئی شناخت ہو سکتی ہے۔ہدف کا پتہ لگانے میں واحد مثبت میں دوبارہ امتحان کی شرح، 10٪ سے زیادہ تک پہنچ سکتی ہے، جس سے کام کا بوجھ بڑھ سکتا ہے اور تشخیص کے وقت کو طول مل سکتا ہے۔ملٹی ٹارگٹ کا پتہ لگانے اور ہر ہدف کے نتائج کی باہمی تصدیق سے پتہ لگانے کی شرح میں اضافہ ہو سکتا ہے اور جلد تشخیص میں آسانی ہو سکتی ہے۔
تصویر 1. نئے کورونا وائرس انفیکشن میکانزم کا اسکیمیٹک خاکہ
برطانیہ کا نیا کورونا وائرس میوٹینٹ B.1.1.7
26 دسمبر 2020 کو، B.1.1.7 سٹرین کا پہلا سائنسی مقالہ آن لائن شائع ہوا۔انسٹی ٹیوٹ آف ہائجین یونیورسٹی آف لندن یو کے اینڈ ٹراپیکل ڈیزیز نے تصدیق کی کہ B.1.1.7 تناؤ دیگر تناؤ کے مقابلے میں زیادہ پھیلنے کی صلاحیت رکھتا ہے، جو کہ 56% (95% CI 50-74%) سے زیادہ تھا۔چونکہ اس نئے اتپریورتی تناؤ میں زیادہ واضح ٹرانسمیشن طاقت ہے، اس لیے COVID-19 پر قابو پانا زیادہ مشکل ہو گیا ہے۔اگلے دن، برطانیہ میں برمنگھم یونیورسٹی نے MedRxiv پر ایک مضمون اپ لوڈ کیا۔اس تحقیق سے پتا چلا ہے کہ B.1.1.7 اتپریورتی تناؤ (S-gene dropout) سے متاثرہ مریضوں میں ORF1ab اور N وائرس کے جین کی نقلوں کی تعداد میں نمایاں اضافہ ہوا ہے۔آبادی میں اس رجحان کی نگرانی کی گئی۔یہ مضمون بتاتا ہے کہ برطانیہ کے اتپریورتی B.1.1.7 سے متاثر ہونے والے مریضوں میں وائرل بوجھ نمایاں طور پر زیادہ ہوتا ہے، اس لیے یہ اتپریورتی زیادہ روگجنک بھی ہو سکتا ہے۔
تصویر 2. برطانیہ کے کورونا وائرس اتپریورتی تناؤ B.1.1.7 میں موجود جینوم میوٹیشن کی ترتیب
شکل 3. N501Y تغیر برطانیہ اور جنوبی افریقہ دونوں میں واقع ہوا۔متغیرات
کورونا وائرس کی نئی قسموں کا پتہ لگانے والی کٹ
Chuangkun Biotech Inc. نے B.1.1.7 اور 501Y-V2 نئے کورونا وائرس کے لیے کامیابی سے پتہ لگانے والی کٹ تیار کر لی ہے۔
اس پروڈکٹ کے فوائد: اعلی حساسیت، 4 اہداف کا بیک وقت پتہ لگانا، B.1.1.7 اتپریورتی تناؤ اور 501Y.V2 جنوبی افریقی اتپریورتی تناؤ کی اہم تبدیلی کی جگہوں کا احاطہ کرتا ہے۔یہ کٹ بیک وقت N501Y، HV69-70del، E484K میوٹیشن سائٹس اور نئے کورونا وائرس ایس جین کا پتہ لگا سکتی ہے۔تیز ٹیسٹ: نمونہ جمع کرنے سے نتیجہ آنے میں صرف 1 گھنٹہ 30 منٹ لگتے ہیں۔
تصویر 4. COVID-19 برطانیہ کے مختلف امپلیفیکیشن وکر کا پتہ لگانا
تصویر 5. COVID-19 جنوبی افریقی ویرینٹ ایمپلیفیکیشن کریو کا پتہ لگانا
تصویر 6. جنگلی قسم کا نیا کورونا وائرس ایمپلیفیکیشن وکر
یہ واضح نہیں ہے کہ یہ تغیرات کس طرح وبائی مرض COVID-19 کے نئے طویل مدتی اثرات کو جمع کرتے ہیں۔لیکن یہ ہمیں یاد دلاتا ہے کہ یہ تغیرات ویکسینیشن کے ذریعے پیدا ہونے والی قدرتی قوت مدافعت اور قوت مدافعت کی تاثیر کو متاثر کر سکتے ہیں۔یہ ہمیں یہ بھی یاد دلاتا ہے کہ ہمیں نئے کورونا وائرس پر طویل عرصے تک مسلسل نگرانی کرنے اور نئے کورونا وائرس کے ارتقاء سے نمٹنے کے لیے COVID-19 ویکسین کو اپ ڈیٹ کرنے کی ضرورت ہے۔
پوسٹ ٹائم: مارچ 12-2021